MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanosalsum zhilinae DSM 4017 chromosome

Total Repeats: 37647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015676	GAAT	2	8	258	265	50 %	25 %	25 %	0 %	336475960
2	NC_015676	A	6	6	290	295	100 %	0 %	0 %	0 %	336475960
3	NC_015676	GGAG	2	8	301	308	25 %	0 %	75 %	0 %	336475960
4	NC_015676	ATCT	2	8	310	317	25 %	50 %	0 %	25 %	336475960
5	NC_015676	AAG	2	6	327	332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475960
6	NC_015676	CCT	2	6	342	347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475960
7	NC_015676	TGA	2	6	373	378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475960
8	NC_015676	ATAA	2	8	383	390	75 %	25 %	0 %	0 %	336475960
9	NC_015676	AT	3	6	446	451	50 %	50 %	0 %	0 %	336475960
10	NC_015676	CTGTA	2	10	540	549	20 %	40 %	20 %	20 %	336475960
11	NC_015676	CTT	2	6	584	589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475960
12	NC_015676	GTT	2	6	692	697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475960
13	NC_015676	ATT	2	6	698	703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475960
14	NC_015676	TGA	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475960
15	NC_015676	GAG	2	6	869	874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475960
16	NC_015676	ATG	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475960
17	NC_015676	CT	3	6	978	983	0 %	50 %	0 %	50 %	336475960
18	NC_015676	AAG	2	6	1018	1023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475960
19	NC_015676	GATCGA	2	12	1117	1128	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336475960
20	NC_015676	GTT	2	6	1133	1138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475960
21	NC_015676	ACA	2	6	1223	1228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475960
22	NC_015676	ATA	2	6	1263	1268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475960
23	NC_015676	AT	3	6	1278	1283	50 %	50 %	0 %	0 %	336475960
24	NC_015676	CTGAT	2	10	1302	1311	20 %	40 %	20 %	20 %	336475960
25	NC_015676	TGT	3	9	1345	1353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475960
26	NC_015676	GAT	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475960
27	NC_015676	CTC	2	6	1581	1586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475961
28	NC_015676	CTG	2	6	1617	1622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475961
29	NC_015676	TG	3	6	1673	1678	0 %	50 %	50 %	0 %	336475961
30	NC_015676	AGG	2	6	1683	1688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475961
31	NC_015676	TCC	2	6	1689	1694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475961
32	NC_015676	CTT	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475961
33	NC_015676	TAT	2	6	1740	1745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475961
34	NC_015676	TCTCCC	2	12	1816	1827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475961
35	NC_015676	AAC	2	6	1920	1925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475961
36	NC_015676	TACC	2	8	1973	1980	25 %	25 %	0 %	50 %	336475961
37	NC_015676	ATG	2	6	2230	2235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
38	NC_015676	TTG	2	6	2248	2253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475962
39	NC_015676	GAT	2	6	2288	2293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
40	NC_015676	TC	3	6	2333	2338	0 %	50 %	0 %	50 %	336475962
41	NC_015676	TGA	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
42	NC_015676	TGAT	2	8	2362	2369	25 %	50 %	25 %	0 %	336475962
43	NC_015676	ATATTG	2	12	2377	2388	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	336475962
44	NC_015676	A	7	7	2398	2404	100 %	0 %	0 %	0 %	336475962
45	NC_015676	ATG	2	6	2428	2433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
46	NC_015676	AT	3	6	2576	2581	50 %	50 %	0 %	0 %	336475962
47	NC_015676	AAG	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475962
48	NC_015676	AG	3	6	2660	2665	50 %	0 %	50 %	0 %	336475962
49	NC_015676	GA	3	6	2700	2705	50 %	0 %	50 %	0 %	336475962
50	NC_015676	TAT	2	6	2720	2725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475962
51	NC_015676	ACA	3	9	2748	2756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475962
52	NC_015676	GGA	2	6	2780	2785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475962
53	NC_015676	TCT	2	6	3113	3118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475962
54	NC_015676	TGGTAT	2	12	3140	3151	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	336475962
55	NC_015676	ATG	2	6	3271	3276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
56	NC_015676	TTG	2	6	3349	3354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475962
57	NC_015676	TGA	2	6	3416	3421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
58	NC_015676	TGG	2	6	3424	3429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475962
59	NC_015676	CAA	2	6	3460	3465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475962
60	NC_015676	ATG	2	6	3480	3485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475962
61	NC_015676	GGC	2	6	3490	3495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336475962
62	NC_015676	GAA	2	6	3539	3544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475962
63	NC_015676	GGCA	2	8	3652	3659	25 %	0 %	50 %	25 %	336475962
64	NC_015676	TGG	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475962
65	NC_015676	TC	3	6	3722	3727	0 %	50 %	0 %	50 %	336475962
66	NC_015676	A	6	6	3859	3864	100 %	0 %	0 %	0 %	336475963
67	NC_015676	CAG	2	6	3893	3898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475963
68	NC_015676	TCA	2	6	3978	3983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475963
69	NC_015676	TGCA	2	8	3985	3992	25 %	25 %	25 %	25 %	336475963
70	NC_015676	ATG	2	6	4006	4011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475963
71	NC_015676	TGC	2	6	4191	4196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475963
72	NC_015676	TTG	2	6	4244	4249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475963
73	NC_015676	AATC	2	8	4320	4327	50 %	25 %	0 %	25 %	336475963
74	NC_015676	ATC	2	6	4395	4400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475963
75	NC_015676	GAA	2	6	4442	4447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475963
76	NC_015676	TCT	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475963
77	NC_015676	TTG	2	6	4547	4552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475963
78	NC_015676	ATG	2	6	4619	4624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475963
79	NC_015676	CA	3	6	4640	4645	50 %	0 %	0 %	50 %	336475963
80	NC_015676	AAATG	2	10	4653	4662	60 %	20 %	20 %	0 %	336475963
81	NC_015676	ATA	2	6	4672	4677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475963
82	NC_015676	GAT	2	6	4678	4683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475963
83	NC_015676	A	6	6	4967	4972	100 %	0 %	0 %	0 %	336475964
84	NC_015676	AAC	2	6	4995	5000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475964
85	NC_015676	AAG	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
86	NC_015676	CCA	2	6	5048	5053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336475964
87	NC_015676	TGT	2	6	5071	5076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475964
88	NC_015676	AAG	2	6	5131	5136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
89	NC_015676	AAT	2	6	5206	5211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475964
90	NC_015676	AT	3	6	5210	5215	50 %	50 %	0 %	0 %	336475964
91	NC_015676	ACA	2	6	5261	5266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336475964
92	NC_015676	C	7	7	5276	5282	0 %	0 %	0 %	100 %	336475964
93	NC_015676	ATT	2	6	5288	5293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475964
94	NC_015676	TTG	2	6	5412	5417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475964
95	NC_015676	AGG	2	6	5476	5481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475964
96	NC_015676	CAG	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475964
97	NC_015676	AAG	2	6	5537	5542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
98	NC_015676	GCT	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475964
99	NC_015676	ATGA	2	8	5582	5589	50 %	25 %	25 %	0 %	336475964
100	NC_015676	AGG	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475964
101	NC_015676	GAA	2	6	5630	5635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
102	NC_015676	CAT	2	6	5657	5662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336475964
103	NC_015676	GAAAA	2	10	5669	5678	80 %	0 %	20 %	0 %	336475964
104	NC_015676	AGGT	2	8	5679	5686	25 %	25 %	50 %	0 %	336475964
105	NC_015676	TGA	2	6	5707	5712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475964
106	NC_015676	GAA	2	6	5774	5779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
107	NC_015676	A	6	6	5778	5783	100 %	0 %	0 %	0 %	336475964
108	NC_015676	AGC	2	6	5830	5835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336475964
109	NC_015676	AAGA	2	8	5854	5861	75 %	0 %	25 %	0 %	336475964
110	NC_015676	A	6	6	5916	5921	100 %	0 %	0 %	0 %	336475964
111	NC_015676	AAG	2	6	5954	5959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
112	NC_015676	AAAAG	2	10	6049	6058	80 %	0 %	20 %	0 %	336475964
113	NC_015676	GAA	2	6	6134	6139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475964
114	NC_015676	GGA	2	6	6164	6169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336475964
115	NC_015676	T	6	6	6225	6230	0 %	100 %	0 %	0 %	336475965
116	NC_015676	TTC	2	6	6339	6344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336475965
117	NC_015676	CTG	2	6	6368	6373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336475965
118	NC_015676	AGA	2	6	6401	6406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475965
119	NC_015676	TG	3	6	6416	6421	0 %	50 %	50 %	0 %	336475965
120	NC_015676	TA	3	6	6439	6444	50 %	50 %	0 %	0 %	336475965
121	NC_015676	AAT	2	6	6450	6455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336475965
122	NC_015676	TGG	2	6	6543	6548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336475965
123	NC_015676	ATG	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336475965
124	NC_015676	ATT	2	6	6692	6697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475965
125	NC_015676	GCAG	2	8	6713	6720	25 %	0 %	50 %	25 %	336475965
126	NC_015676	GAA	2	6	6768	6773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336475965
127	NC_015676	TA	3	6	6797	6802	50 %	50 %	0 %	0 %	336475965
128	NC_015676	A	7	7	6838	6844	100 %	0 %	0 %	0 %	336475965
129	NC_015676	ATCG	2	8	6850	6857	25 %	25 %	25 %	25 %	336475965
130	NC_015676	TTG	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336475965
131	NC_015676	AT	3	6	6964	6969	50 %	50 %	0 %	0 %	336475965
132	NC_015676	ATT	2	6	7024	7029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336475965
133	NC_015676	ACC	2	6	7150	7155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336475965
134	NC_015676	CAGG	2	8	7185	7192	25 %	0 %	50 %	25 %	336475965
135	NC_015676	TCC	2	6	7237	7242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336475965
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